Здравствуйте,
стандартный механизм начала работы с обменом данных о товарах с сайтом Битрикса выглядит следующим образом:
1. Запускается обработка обмена с сайтом;
2. заполняются корректные настройки обмена;
3. перед самой первой выгрузкой товаров ставится флаг "Полная выгрузка всех объектов";
4. сохраняются настройки;
5. проверяется возможность подключения к сайту (нажав соответствующую кнопку в командной панели обработки);
6. если соединение прошло успешно, то можно произвести полную выгрузку товаров;
7. после успешной выгрузки товаров в настройках обмена с сайтом вместо флага "Полная выгрузка всех объектов" ставится флаг "Выгружать только изменения".
При такой схеме полная выгрузка потребуется только 1 раз перед началом заполнения сайта, дальше будут передаваться только изменения в товарах и заказах. Это позволит заметно сократить время/объем выгрузки.
Если вы выгружаете картинки товаров, то убедитесь, что они сохранены в сжатом формате изображений - jpeg, png и имеют разумный размер (мегабайтные картинки в bmp будут очень долго передаваться на сайт из-за их размера).
Также в настройках на закладке "Выгрузка товаров" Вы можете настроит отбор, по которому будут выгружаться товары. Это позволит выгружать только определенные товары.
Также через панель администрирования сайта битрикса можно перети на вкладку "Магазин", затем "Интеграция с 1С", в "Настройка параметров импорта каталога" указать: "Использовать сжатие zip, если доступно:". Можно попробовать задать меньший размер у параметра "Размер единовременно загружаемой части файла (в байтах):", но это не рекомедуется.