Установленное оборудование и себестоимость автомобиля

Тогда требуется уточнение. Т.к. комплектация автомобиля осуществляет приход установленного допоборудования, то что должно произойти? Куда должны быть списаны детали (и выполненные работы)?
Единственное что приходит на ум, то это приход деталей на регистр комплектации с нулевой себестоимостью, работы при этом вовсе не делают приход на регистр остатков автомобилей, себестоимость деталей при этом учитывается как расход по регистру доходов и расходов.
Разве что как то так.

Дмитрий, а можно прокомментировать, почему ?

Не могу понять такого требования с точки зрения здравого смысла.
Может имеется в виду, что не должно увеличивать ПРОДАЖНУЮ СТОИМОСТЬ автомобиля ?

Нет, именно себестоимость)

Все расходы, связанные с комплектацией, установкой и т.д. ложатся на подразделение и не должны касаться себестоимости. Не спрашивайте, почему) Специфика бизнес-процессов.

Я так понимаю, штатными настройками вопрос не решить?

Да, конечно.
Такой сценарий мы не рассматривали.
Потребуется модификация проведения документов
как написал Александр Яблочкин

Скажите пожалуйста точнее, если можно - с точностью до процедуры)И движения по каким регистрам нужно править?

В ЗН в процедуре ПровестиПоПартиям есть фрагмент
Если ШапкаДокумента.ВидРемонта=КомплектацияАвтомобиля ИЛИ НаСебестоимость Тогда
Далее по тексту сумму работ надо всю переложить на доходы и расходы (сейчас пишется на ОстаткиАвтомобилей).
Фрагмент
Если НаСебестоимость Тогда
Если СуммаНаСебестоимость<>0 ИЛИ СуммаУпрНаСебестоимость<>0 ИЛИ СуммаНДСНаСебестоимость<>0 Тогда
Аналогично движение по ОстаткиАвтомобилей надо убрать, и себестоимость деталей аналогично на ДиР.

Разумеется все это надо проверять.